花中創校於1936(民25)年6月5日，迄今已有85年之歷史矣。
初由花蓮地方熱心教育人士捐資興建，名曰「花蓮港中學校」；1937(民26)年10月改為日制「廳立花蓮港中學校」；1945(民34)年，台灣光復，12月改校名為「臺灣省立花蓮中學」，林民和先生為首任校長，繼為張鼎昌先生、陳國鈞先生、周封岐先生、許伯超先生、羅葆基先生；1968(民57)年，實施九年國民義務教育，停辦初中，1970(民59)年專辦高中，定校名為「臺灣省立花蓮高級中學」，2000(民89)年2月1日廢省後更名為「國立花蓮高級中學」，歷葉清元先生、張清德先生、喬兆坤先生、陳宣經先生、李詩雲先生、葉日陞先生、謝寶珠女士、詹滿福先生，2020(民109)年8月1日由楊鵬耀先生接任花中校長。
本校依山傍海，水清木華，太平洋奔騰浩壯，美崙山遼闊青蒼；老榕林代表傳統精神，麵包樹象徵新生力量，交織成這一古樸而不先矍鑠，青春而不失沉穩，歷史悠久，銳氣勃發的學校。在這面積9.6公頃(約近3萬坪)的校地上，歷經了地震颱風等自然災害，更迭了從日據到光復的人事替隸，在每一任校長的睿智=領導與全體師生的團結奮發下，花中從瓦礫中重建，在烽火中新生。此等執持正道，不為物遷，焦論環境如何變異，依然堅守崗位、克盡職責的精神，正是花中的最佳表現。今天，校園中矗立的辦公大樓(忠孝樓)、教學大樓(仁愛樓、信義樓、和平樓)、圖書館、科學館、藝能大樓、體育館、綜合大樓、圖資大樓、游泳池、體適能中心等，塑造了花中的新面貌；而師生休戚同心，榮辱與共的愛校精神，仍然深植其中，萬古常新。
1950(民39)年11月2日及40年12月26日先總統 蔣公兩度蒞臨本校，駐蹕期間， 蔣公到各教室巡視，親自抽閱學生的作業，垂詢學生的生活情形，並親題「為國育才」四字勗勉，這是花中的光榮，也是花中的責任。因此本校在這個教育目標下，從本國籍學生僅有123人的日治時代，到今天在校生計36班共1100餘人，半世紀來培育國家人才近3萬餘人，傑出校友無數，曾在行政院擔任閣員的有副院長邱正雄、外交部長歐鴻鍊、財經學者曾巨威、公平會主委吳秀明、最高法院檢察署檢察總長黃世銘、自然科學如吳茂昆、林明瑞等，教育學家如陳漢強、吳武典等，財經管理專家如林建山、許士軍、林文英等、文學作家楊牧、王禎和、陳雨航、陳黎、陳克華、王尚智等，花蓮縣歷屆縣長傅崐萁，吳水雲、王慶豐、吳國棟、張福興等，歷屆立委莊金生、陳道明、楊仁福、鄭天財、王廷升等…不計其數，散居各地，服務鄉梓，貢獻國家社會。
近年來，同學在各方面屢有傑出的表現。藝文：管樂隊、國樂團等屢獲全國樂樂比賽特優；體育：籃球隊曾勇奪全國高中乙級聯賽冠軍，足球隊於全國足球聯賽中，2017、2018獲季軍、2022年獲亞軍、2021年勇奪冠軍；數理：於全國性的數學、自然科學相關競賽中更屢創佳績，在國際奧林匹亞科學競賽，本校自1999年至2022年總共已榮獲國手20人，國際生物5金、2銀、國際化學1銀、國際物理4金1銀3銅、國際地球科學1金，數學科國際榮譽獎。自2021年起本校已有數十位學生榮獲全國「青少年傑出志工及親善大使獎」。升學部分：近十二年來國立大學升學率已高達46%，醫科每年錄取5至8人，國立中字輩以上頂大每年錄取90至110人。
展望未來，有樸實上進的學生，有誨人不倦的師長，更有山風海雨的自然沐化，並在地方各界的支持與期望之下，花中仍將是屹立於太平洋之濱、一所默默「為國育才」、人人稱羨的學府。
